mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTGCTGGGGCCTCCA CCCAGGGGTGTTAGAGAAAACGCCACACTTTGAGATG CCGGCTCTCACCCGGTGGTGTTAATATCTTGCTGGGGCCTCCAGAATGTTTTGCCCAGGGGTGTTAGAGAAAACGCCACACTTTGAGATGAATTAAGAGTCCCTTATTAG 1 30 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-720 1e-56 ptr-mir-720 5e-43 -28.5 ..((((((((((....))))....((((((.(((((.....((((....))))))))).((((((......)))))).......)))))).....))))))......... (-28.50)