mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCGGGGCTAGGGCTAACAGCA CTGTTGCCACTAACCTCAACC TTGGGCAAGGTGCGGGGCTAGGGCTAACAGCAGTCTTACTGAAGGTTTCCTGGAAACCACGCACATGCTGTTGCCACTAACCTCAACCTTACTCGGTC 2 3 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-744 9e-45 hsa-mir-744 8e-51 -38.9 (((((.(((((..((((.((((((.(((((((.((.....)).((((((...)))))).......)))))))))).))).)))).))))).))))).. (-38.90)