mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCAAAAAGCTGTGAGTCA ACTGACACCTCTTTGGGTGAA GGCAGTGCTCTACTCAAAAAGCTGTGAGTCACTTAGATTACATGTGACTGACACCTCTTTGGGTGAAGGAAGGCTCA 3 0 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase 100 hsa-mir-888 5e-36 -27.8 (((..(.((.((((((((.((.(((.((((((...........)))))).))).)).)))))))).)).)..))).. (-27.80)