mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCCTTAAAGGTGAACCCAGT CGTGGTACACCTTTAAGAACT GAAGGTGTACCATGTGCCCTTAAAGGTGAACCCAGTGCACCTTCATGAACCGTGGTACACCTTTAAGAACTTGGTACGCCTTC 3 3 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-938 6e-36 hsa-mir-938 1e-39 -39.7 ((((((((((((.((...((((((((((.((((.((.((......)).)).).))).)))))))))).)).)))))))))))) (-39.70)