mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGGAGCTGAGGCTCTGGGAGTG ACTCTGGGCCTCTGCTCCCCAGT TGTGGCAGGGTCTGGGGAGCTGAGGCTCTGGGAGTGGCCGGAGCTGACTCTGGGCCTCTGCTCCCCAGTGTCTGACCGCG 1 3 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-939 8e-20 hsa-mir-939 2e-26 -52.8 .((((((((..(((((((((.(((((((..((((((((....))).)))))))))))).)))))))))..)))).)))). (-52.80)