mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGTCGCCGCCACCCGAGCCG GCTGGGCCGCCAAGGCAAGATGGTG TCCACCGCTGCCGCGGTCGCCGCCACCCGAGCCGGAGCGGGCTGGGCCGCCAAGGCAAGATGGTGGACTACAGCGTGTGGG 4 6 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase 100 hsa-mir-1181 5e-36 -39.6 .(((((((((((((.((((((((..(((.((((......)))))))..))...)))..))).))))....))))).)))). (-39.60)