mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGACACATGGTCTACTTCT ATGCGGTTGACCATGGTGTGTACG ACTTCCTGGTATTTGAAGATGCGGTTGACCATGGTGTGTACGCTTTATTTATGACGTAGGACACATGGTCTACTTCTTCTCAATATCA 5 3 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase mir-154 1e-31 hsa-mir-1197 2e-42 -26.4 .......((((((.(((((...(((.(((((((...(.(((((.........).)))).)...))))))).))))))))..)))))). (-26.40)