mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCTTCCCCTTGTCTCTCCAG GTGAGTGACAGGGGAAATGGGGAT GTGAGTGACAGGGGAAATGGGGATGGACTGGAAGTGGGCAGCATGGAGCTGACCTTCGTCATGGCTTGGCCAACATAATGCCTCTTCCCCTTGTCTCTCCAG 3 4 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase 100 hsa-mir-1236 9e-51 -39.4 (.(((.((((((((((..((((...(((..((((.(..((((.....)))).)))))))).((((...))))........)))))))))).)))).)))).. (-39.40)