mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCCGTCCCGTTCGTCCCCGGA CGGGAACGTCGAGACTGGAGC CCGCTTGCCTCGCCCAGCGCAGCCCCGGCCGCTGGGCGCACCCGTCCCGTTCGTCCCCGGACGTTGCTCTCTACCCCGGGAACGTCGAGACTGGAGCGCCCGAACTGAGCCACCTTCGCGGACCCCGAGAGCGGCG 6 1 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase 100 hsa-mir-1247 2e-73 -57.7 .((((.((((((.((.(((.((....(((((.(((((((.((.(((.((..(((.(((((..((........)).))))).))).)).))).)).)))))))...)).)))..)).)))))....)))).)))))) (-57.70)