mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACCTTCTTGTATAAGCACTGTGCTAAA TAGCAGAGTACACACAAGAAGAAAA TTTACCTTCTTGTATAAGCACTGTGCTAAAATTGCAGACACTAGGACCATGTCTTGGTTTTTGCAATAATGCTAGCAGAGTACACACAAGAAGAAAAGTAACAGCA 8 2 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase SNORA81 6e-43 hsa-mir-1248 2e-55 -34.5 .....((((((((....(.(((.(((((..((((((((.((((((((...)))))))).)))))))).....))))).))).)..))))))))............. (-34.50)