mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGATGAGCAAAGAAAGATTTTT GAAACTATCTTCTTTGCTCATCCTTG ATTGGAAATCCTTTGAGTTGCTTCTCAAGGATGAGCAAAGAAAGATTTTTTAGATTCTGGAGAAACTATCTTCTTTGCTCATCCTTGAGAAGCAACTCCTTATCCATTAA 1 3 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase 100 hsa-mir-1255a 1e-46 -55.7 ..((((........((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((...)))))))).))...))))))))))))))))))))))))))))....)))).... (-55.70)