mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGGTACCCTGGCATACTGAGT TCAGTATACCATAGTGCCATAT CTACCCCAAAATATGGTACCCTGGCATACTGAGTATTTTAATACGGGCATACTCAGTATACCATAGTGCCATATTTTGGGGTAG 3 0 5' arm Pongo_pygmaeus mirbase 100 ptr-mir-1263 2e-35 -49.5 (((((((((((((((((((..(((.(((((((((((.((......)).))))))))))).)))..))))))))))))))))))) (-49.50)