mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGGACTGAGCCATGCTACTGG AGTTGGCGTGGCTCAGTCCAAGTCTGACGACCTGAGGA GATTGCCTAGAACAGGGAAGCCAGTTGGCGTGGCTCAGTCCAAGTCTGACGACCTGAGGAATGCCTGGACTGAGCCATGCTACTGGCTTCCCTGGTCTCCAGC 0 16 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase 100 hsa-mir-1269 3e-44 -63.5 ....((..(((.(((((((((((((.(((((((((((((((..(((....)))...(((....))))))))))))))))))))))))))))))).)))...)) (-63.50)