mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTT GCTCAAGAAAGCTGTGGGAGA AAGTCCTGGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCACTGTTTGCTGATTAATACACGGCTCTTGCTAGCTAGGCGCCGTATGTAGACACCGCGCGCCATGGGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAACATGGCACACCTT AGAGTGGTCCTTGAAATAGCCTCTTTGTATGGGCTTCCTGCTTAATTCTTCCTCTCTAACATCGAGTGTAAAATGAATGGAAGATCATCAAGCCACAGATATGAGATCTGAACATTATTATTATTAAGTCCTGGTCATGCTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTCCACTGTTTGCTGATTAATACACGGCTCTTGCTAGCTAGGCGCCGTATGTAGACACCGCGCGCCATGGGAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAGAACATGGCACACCTTCAGGATTTGCCTGCTCGCCAGATACCTCATCCTTTGGTATGCCGGCGGCCCTGCCAAGATCTTCCCCACGGTCTTCTTCCCGGTAATCAATTGTATATATTTTACCCTTAATTCCTATACAATTATAACTTTTTATATTTATTTATTACTTCTTAGAATTGTATACACAGTAACCCTCTTAAATTCTTGCATTATCCTGTGACAGAAGCGCTTCTTTAAGCTAGCTAGCTGTGACTGTGATTCATGTTCAAAATGTGAATTTTCTCATTTGACACTGACAACAAGGTTCCAAAATATACGTTCAAGAACAGATCAAAATCACCCTGCAACATGATTTTGTCTTTGTTTTTACACACACTCATTTTATATTTACTGTTTTAACACATGAGCTCCATTATGCATGGAGTGTGTGTGTAAAAACTATCCTAGTTTGCTGTAAATTTTTTATGTACAGTTTTTCTTCGCAAATAAATGGGTTTGTGTGATTGCGTTCTGTACATTCCATTAAAATGGTGAAAAATGTATATTTACTTTTGCAGGGAGGAGAATCCCCAGCTTTAATTGCTTTCTAATATTTTATCTGGAAAAATTTTTAGTTCTTTCTGTTGGCCCTTTTGGTTTTGCCTCCCCTTGAACATGATGAAATCCCTACTTTTCTGGGAAAAAAGGTTCCCTTTTGCCCCTTTGTGACATCCTTTTTTAAACCCCCCCCCCTTCATCCGAAAACCCGTTTTTATTAAAATTTAAATTTTTGCCTAACCCAACCCCCCCCCTCCCCCCCGGG 1 0 5' arm Citrus_clementina mirnest MIR396 0.000000000002 ccl-MIR396 2e-77 -58.1 ........((((((.(((((((((((((((((((.((((((..((.(((((.((.(((.(((((.((((.....)))).))))).))).))))..))).))..)))))).))))))))))))))))))).))))))....... (-58.1)