mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGGACATACTTATGCTAAA TAGTACATGTATGTCTGGTGC ACAACATTTTTTTTAGTACATGTATGTCTGGTGCAACAATTGGGACATACTTATGCTAAAAAAATTAGTGTTC 5 0 3' arm Pongo_pygmaeus mirbase 100 ptr-mir-1302-7 9e-16 -21.1 ..((((((((((((((((...((((((((.(.........).))))))))...)))))))))))...))))). (-21.10)