mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCGGTTTATGTTCGGTTTA AACCTTAAAAACCGGTTTG TTTTTGTCCCAAACCGGTTTATGTTCGGTTTAACCAGTTTGGGTTTGAACCTTAAAAACCGGTTTGAAACAGCC TCGAATCGGGCAAAAAACCGGTTTGAATATAAAAACCGGACCGGTTTTTGGAAAACCGCTTTCAACCCGATTCGACCCGGCAGTTGTTGACTGGTTCATATTCCCATACTTTAAAACCAGTTTATAAACCGAACAAGTAGTAACAAAAAACCCTGTTTTTTTGTCCCAAACCGGTTTATGTTCGGTTTAACCAGTTTGGGTTTGAACCTTAAAAACCGGTTTGAAACAGCCCGGTTTGTTTACAGCTTAAAAAACAGGTTCGGCTTAAATTGCGGTTCGGTTTGTAAAGAAAAACAGGTTCGGCTTAAATAGCGGTTCGGTTTGTAAAGAAAAACCGGTTTGATTAAAACTATTTTTATATGCAGATATTGGGGGATGGATTGGATTCAAAGAAAAATGATCCTATTAGCTAATGCGAATCGTATTCAATCTAACGGTTGTTTTTACAACATCATCAATATG 2 2 5' arm Helianthus_annuus mirnest 100 100 -25.8 ...((((..(((((((((((.((...(((((((((......)).))))))).)).)))))))))))..)))).. (-25.8)