mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTAGGGATGGAAGCCATGA ATGGCTTTTTATTCCTATGTGA TGATCAAGATAAATTCACTCTAGTGTTTTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATAGTAATAAAGTCTCATGTAGGGATGGAAGCCATGAAATACATTGTGAAAAATCATCA 0 1 3' arm Ornithorhynchus_anatinus mirbase mir-135 1e-44 gga-mir-135a-2 6e-52 -39.1 .......(((...(((((....((((((((((((((((.((((((((((((.(.(.....).).))))))))))))))))))))))))))))...)))))..))).... (-39.10)