mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGATGAAGCACTGTAGCTC GGTGCAGTGCTGCATCTCTGG GATGTCTCCCAGCCCAAGGTGCAGTGCTGCATCTCTGGTCAGTTGTGAGTCTGAGATGAAGCACTGTAGCTCGGGAAGGGAGGAGCTGTC 4 0 3' arm Ornithorhynchus_anatinus mirbase mir-143 8e-45 xtr-mir-143 6e-39 -45.6 ....((((((..(((.((.(((((((((.((((((.(((((....))).)).)))))).))))))))).)).)))..))))))....... (-45.60)