mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTATAGATGATGTACT GATATCATCGTATACTGTAAG GGCTTTGCCTGCTCTGAGGCGCCCCCATTGTTGCCCGGGGCCCTGGCGGGGATATCATCGTATACTGTAAGTTTGCTATGAGACACTACAGTATAGATGATGTACTAGCCCGGGTGCCCCAGCCCAGCAGGAGCC 1 1 3' arm Ornithorhynchus_anatinus mirbase mir-144 4e-26 hsa-mir-144 4e-29 -60.7 ((((...(((((((((.(((((((........(((...)))...(((.((.((((((((.(((((((((.((((......))))..))))))))))))))))).)).))).))))))).)))...)))))))))) (-60.70)