mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCACTGCTCTATCTGTCATC TTTTTATTTCATGTCTTGCTTACCCTATTTAGAGATCAGATATAGATAGAAATGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGCCGAATTGTACCGAAGTGACTTGTTGTATGATTGATTTGGGTGCTCACTGCTCTATCTGTCATCTTCATTCTTAATCATCTCAAAGGGTGTGATGACTGATGTGTCTGTCTAT TTTTCCCAAAGTACATCAAGTACTCAATGCCCTTTAATCATACCCACTCAGAGAGTAAGAGTTTTGTCATCGTTGTTTCTTGTTTTGGTTTTCTGGAGGTTTGTTGTGCCTTTTTATTCAACCCTAGATGATGTTTACCTTTCCTTAAATGGGTATTTTGCTTTGTGTGTTTACAGATCTGACTTTGTAATCTTTTTGTTTTTATTTCATGTCTTGCTTACCCTATTTAGAGATCAGATATAGATAGAAATGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAAGCCGAATTGTACCGAAGTGACTTGTTGTATGATTGATTTGGGTGCTCACTGCTCTATCTGTCATCTTCATTCTTAATCATCTCAAAGGGTGTGATGACTGATGTGTCTGTCTATCAAAATTAAAACATTCTTACTGTGTTTGTTATGTTGGGATTTTTGTGGCAAAAATGGAAGAAACACACCTGAAATAGTCTCTTGTTTGTGTGTTTGTTTTGGGGTTTAATAAATAAAATAATGATGGTTGTACTTGAATAATATATATTAATGCTAGACTTGTTAATTAGCAGTAGGGTTTAGTTTGTTGAGAGTGAGACTTTTCATGGTTTACTGTTCTAGATTAACGGAAAACTGACATTATTATGACACTATTGTCTTAACAAGCTTGCTCTTTAGTCTTACCCTCTCTTTCTTTTTAATTTTGACTTTTTCTCACAGAGATTCTTGGGTATCACTGGTTTAATGTTTGTGATCTGATCTATAATCCTAACATCAGGGTATCTGTTTGCATCTATCCCTAGATTGTTTTTTGCAAATAGATCTCTACAACATGTCAAATGTGAAC 1 2 5' arm Helianthus_annuus mirnest mir-156 0.000003 ath-MIR156d 0.0000002 -54.4 ....(((.(((.(((.....((((((..((.(((((..(((..(((..((((((((((((((((((((((((.((((....(((((((((((......)))..))))))))..)))).))))))))).)))).)))))))).)))..)))..))))))))))))))))....)))))).)))......... (-54.4)