mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGGTTGCAGCTTCAAT GTTTATGTTTGTATGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATAATGCCAAACTGATTTGCCTATGTGTTTTTGTGTCATGGTTTCTAGTGTGTATGTAGATTAACTGTGTCTTGTGGGGTGTTCTAGTGTGTGTGTGTGTTTTCATGGTGTATCCAGTGTGTGTGTTTATGGGTAGGGTAAAGAAAGGTTAATCAGGTCATGGTTGCAGCTTCAATTACTCATTACCAACAGTT CGGGGATGAGAGAGAGAGTATAGCTAGAGAGAGAGATGAATAGGTCAACTTTGAATAGCTGGAAGAAAGGCACAAAACCTCATTACTGTTGAGATCTCTCTCTATATAAGATGATACTGTTTACAAGAAAGATATATAAGCTTTACAAGAGTAGAGAGTGCTATTTCCAGCCATAAATTCTCTATTTTTGTTCTTCTCTATCTATCTTTATTCAGTTTATGTTTGTATGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATAATGCCAAACTGATTTGCCTATGTGTTTTTGTGTCATGGTTTCTAGTGTGTATGTAGATTAACTGTGTCTTGTGGGGTGTTCTAGTGTGTGTGTGTGTTTTCATGGTGTATCCAGTGTGTGTGTTTATGGGTAGGGTAAAGAAAGGTTAATCAGGTCATGGTTGCAGCTTCAATTACTCATTACCAACAGTTTATCATACAAAGAAGGCTTGTTGTAGAATCCTTTCATGATTATTTGGCATGGGCTTTCTTTTCTTGTTTGGCATATGGTGGATCTCATCTCATGTGAAATGACCAATCAATTCAAGTAAGTACTATAACTTGATTGTTCATGTTTCTTTGATTTGTCTCTTTCACTTTTTTTTATCTTTCATTGTTTAATTTTCTTATTGATTTCCTCAACTAACTTTTGTTTTATTAATATCTCTCANATTAATATATATTTGTTGCATTTATTAATTAGATTTGAATCATCGCTTTCAACTTTTGATTTAATCTTCTACTTTTACATTCTCATGCGGATTAGTATTTTATTCTTGTGCCTACTTTCTTTAAACTTTTTATTTAATACATGAAC 3 0 5' arm Helianthus_annuus mirnest MIR167_1 0.000000004 csi-MIR167c 0.0000000008 -58 .....((((.(((((((.((((((((((((...(((((((((((.((((((.(((((..(((((.........((...(((((((((((.........))))..)))))))...))..))))).)).))).)).))))(..(((((......((((((.............)))))).......)))))..).)))))))))))...)))))))))))).)))).))).))))... (-58)