mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCC TGTTCACAGCGGACCTTGAT AGGCCTCTCTCTCCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAAATGTCCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAATGGGGCTG 4 0 3' arm Mus_musculus mirbase mir-124 1e-28 mdo-mir-124a-1 4e-43 -35.92 .((((((..(((..((((((((.(((..((((((((.............))))))))..))).))))))))..)))..)))))). (-35.92)