mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCC GTGTTCACAGCGGACCTTGAT CTCTGCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCTATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAG 3 1 3' arm Mus_musculus mirbase mir-124 4e-27 mdo-mir-124a-3 4e-33 -25.8 (((((.((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).))))))))).)))) (-25.80)