mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACGGGTTAGGCTCTTGGGAGCT TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA TGCGCTCCCCTCAGTCCCTGAGACCCTAACTTGTGATGTTTACCGTTTAAATCCACGGGTTAGGCTCTTGGGAGCTG 5 0 3' arm Mus_musculus mirbase lin-4 5e-27 mmu-mir-125b-1 2e-38 -30.7 ...........(((..((..(((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).)))..))..))) (-30.70)