mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTG GCTGGTAAAATGGAACCAAATC GCTAAAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCGCCTCTTCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGC 5 0 3' arm Mus_musculus mirbase mir-133 3e-22 rno-mir-133a 4e-33 -27.8 ((((.(((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..))))))).)))) (-27.80)