mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTG GCTGGTAAAATGGAACCAAATC AGAAGCCAAATGCTTTGCTGAAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCAGCTGTTGGATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTGCGCATTGATCACGCCGCA 5 0 3' arm Mus_musculus mirbase mir-133 5e-31 ssc-mir-133a-1 3e-38 -35.6 .(..((..(((((...((((.(((((((..((.((.((((((((..(.....)...)))))))).)).))..))))))).))))...)))))......))..). (-35.60)