mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTA GCTGGTCAAACGGAACCAAGTC CCTCCAAAGGGAGTGGCCCCCTGCTCTGGCTGGTCAAACGGAACCAAGTCCGTCTTCCTGAGAGGTTTGGTCCCCTTCAACCAGCTACAGCAGGGCTGGCAAAGCTCAATATTTGGAGA 4 0 3' arm Mus_musculus mirbase mir-133 7e-43 mml-mir-133b 4e-44 -61.2 .(((((((..((((.((((((((((.((((((((..((.((.((((((.((.((((...)))))))))))).)).))..)))))))).)))))))..)))...))))....))))))). (-61.20)