mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA ATATAGGGATTGGAGCCGTGGC AGGCCTCACTGTTCTCTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATTCTATTGCTCGCTCATATAGGGATTGGAGCCGTGGCGTACGGTGAGGATA 1 1 5' arm Mus_musculus mirbase mir-135 2e-30 cfa-mir-135a-1 9e-32 -43.92 ...(((((((((.(.((((((((((..((((((((((((.............)))))))))))).)))))))))).).)))))))))... (-43.92)