mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA ATGTAGGGATGGAAGCCATGAA AGATAAATTCACTCTAGTGCTTTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATCGTAATAAAGTCTCATGTAGGGATGGAAGCCATGAAATACATTGTGAAAATTCA 0 1 5' arm Mus_musculus mirbase mir-135 5e-40 rno-mir-135a 5e-52 -34.8 .((....(((((....(((.((((((((((((.((((((((((((.(........)..)))))))))))))))))))))))).)))...)))))...)). (-34.80)