mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTCATTCCTATGTGA ATGTAGGGCTAAAAGCCATGGG CGCTCTGCTGTGGCCTATGGCTTTTCATTCCTATGTGATTGCTGCTCCGAACTCATGTAGGGCTAAAAGCCATGGGCTACAGTGAGGGGCAAGCTCC 2 1 5' arm Mus_musculus mirbase mir-135 2e-36 rno-mir-135b 8e-48 -49.7 .((((((((((((((((((((((((...((((((((((...(......)...))))))))))..)))))))))))))))))))..)))))....... (-49.70)