mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCGACCACGGGGTCGAGT TCGACCACGTGGTTGAGTAGT TGAAGGTGATGAAGGTACTCGACCACGTGGTTGAGTAGTGTGATCGAGTGAAGGTGATGTGGTGGACGTGATGATACTCGACCAGGGGGTCGAGTAATGTGATCGAGTGGTTGTCCAGGTGGTACTCGACCATGGGGTCGAGTGGTGACGTGAAGTGCTGAGGTCTTCTACTCGACCACGGGGTCGAGTGGTCTGTTGATGTCG TGGTGGTACTCGGCTTGGTGGTAGAGTGATCGAGTGAAGGTGATGAAGGTACTCGACCACGTGGTTGAGTAGTGTGATCGAGTGAAGGTGATGTGGTGGACGTGATGATACTCGACCAGGGGGTCGAGTAATGTGATCGAGTGGTTGTCCAGGTGGTACTCGACCATGGGGTCGAGTGGTGACGTGAAGTGCTGAGGTCTTCTACTCGACCACGGGGTCGAGTGGTCTGTTGATGTCGTG 1 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirnest MIR854 0.00000005 100 -76.4 .((...((((((...(((((((((.(((((((((((((...((((.((((......((((..(((((.((((.((((((((((....)))))))))...).)))).......)))))...(.(((((((((....))))))))).).))))....))))..))))..))))))))))))).))))))))).)).))))...)). (-76.4)