mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAGCATCAGTGATTTTGTTG ACAATATCCTGGTGCTGAGT CAACGCTGCACAGGCCGTCCTCCCCAACAATATCCTGGTGCTGAGTGGGTGCACAGTGACTCCAGCATCAGTGATTTTGTTGAAGAGGGCAGCTGCCA 1 2 3' arm Mus_musculus mirbase mir-338 3e-38 mmu-mir-338 8e-51 -42.2 ............(((.((((((..((((((.(((((((((((((((.(.(....).).))).))))))))).))).))))))..)))))).))).... (-42.20)