mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTCGATCGGTCGGTCGGT CGGTCGGCCGATCGCTCGGTC AAAATGATGATGTCAGTTGGCCGGTCGGCCGATCGCTCGGTCTGTCAGTCAGTCGGTCGGTCGATCGGTCGGTCGGTCAGTCGGCTTCCTGTCTTC 4 0 3' arm Mus_musculus mirbase 100 rno-mir-341 0.00007 -47.1 .....(((((.(((..(((((((..((((((((((..(((.(((.(.....).))))))..))))))))))..)))))))..))).))..)))... (-47.10)