mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATATAACCACTGCCAGACTGA AGTCAGGCTAGTGGTTATACTCCA AGATTTCATCAGTCAGGCTAGTGGTTATACTCCAGGACTTATCTGGTCCTGGATATAACCACTGCCAGACTGAATGGTGC 2 2 3' arm Mus_musculus mirbase mir-344 6e-39 mmu-mir-344d-2 2e-23 -45.2 .....(((((((((.(((.((((((((((.(((((((((.....)))))))))))))))))))))).))))).))))... (-45.20)