mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCTGCCCGAGTGCCTGCCTCT AGGCAGGGGCTGGGCCTGCAGC TCTGTGTTGGGCGTCTGTCTGCCCGAGTGCCTGCCTCTCTGTTGCTCTGAAGGAGGCAGGGGCTGGGCCTGCAGCTGCCTGGGCAGAGCTGCTCCTTC 4 1 5' arm Mus_musculus mirbase mir-346 9e-45 rno-mir-346 5e-46 -50.6 (((((.(..((((.((((..((((.(((.((((((((.((..........)))))))))).)))))))..)))).))))..))))))........... (-50.60)