mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAAAGCCCATACACTTTC AAGTGCATGCGCTTTGGGACA AGATGCCTTGCTCCTACAAGAGTAAAGTGCATGCGCTTTGGGACAGTGAGGAAAATAATGTTCACAAAGCCCATACACTTTCACCCTTTAGGAGAGTTG 3 1 3' arm Mus_musculus mirbase mir-350 8e-39 rno-mir-350 1e-46 -32.12 ..........((((((.(((.((((((((.(((.(((((((((((.............))))).)))))).))).)))))).)).)))))))))..... (-32.12)