mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACATAGAGGAAATTTCACGT GTGGATATTCCTTCTATGTTTA TTTGGTATTTAAAAGGTGGATATTCCTTCTATGTTTATGCTTTTTGTGATTAAACATAGAGGAAATTTCACGTTTTCAGTGTCAAA 3 1 3' arm Mus_musculus mirbase mir-154 9e-23 rno-mir-376c 2e-35 -28.8 .(((..(((.((((.(((((..(((((.(((((((((.((.....))...))))))))))))))..))))).)))).)))..))). (-28.80)