mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCACACAAAGGCAACTTTTGT AGAGGTTGCCCTTGGTGAATTC TGAGCAGAGGTTGCCCTTGGTGAATTCGCTTTATTGATGTTGAATCACACAAAGGCAACTTTTGTTTG 1 2 3' arm Mus_musculus mirbase mir-154 2e-29 cfa-mir-377 1e-30 -27.8 .((((((((((((((.(((((((.(((((.........).)))))))).))).)))))))))))))). (-27.80)