mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTTACCCGAGCAACTTTGCAT GACGAATGTTGCTCGGTGAACCCCT TGGTACTCGGAGAGAGGTTACCCGAGCAACTTTGCATCTGGAGGACGAATGTTGCTCGGTGAACCCCTTTTCGGTATCA 5 2 5' arm Mus_musculus mirbase mir-154 6e-30 mmu-mir-409 1e-39 -38.1 .(((((.(((((((.((((..((((((((((((((........).)))).)))))))))..)))).)))))))))))). (-38.10)