mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATATAACACAGATGGCCTGT AGGTTGTCTGTGATGAGTTCG GGGTACTTGAGGAGAGGTTGTCTGTGATGAGTTCGCTTTATTAATGACGAATATAACACAGATGGCCTGTTTTCAATACCA 5 0 3' arm Mus_musculus mirbase mir-154 9e-29 bta-mir-410 2e-38 -35.8 .((((.(((((((.((((..((((((.((.((((((.........).))))).)).))))))..)))).))))))))))). (-35.80)