mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTCGACCAGCTGGAAAGTAAT GTACTTCACCTGGTCCACTAGC GGGTATGGGACGGATGGTCGACCAGCTGGAAAGTAATTGTTTCTAATGTACTTCACCTGGTCCACTAGCCGTCGGTGCCC 2 3 5' arm Mus_musculus mirbase mir-412 1e-27 mmu-mir-412 4e-40 -33.3 ((((((.(.((((.((((.((((((.(((..((((((((....)))).))))))).)))))).)))).))))).)))))) (-33.30)