mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCATATGTAGGATGTCCCAT TGAACATCCTGCATAGTGCTGCC ACGAGGAGGTTGAACATCCTGCATAGTGCTGCCAGGAAATCCCTACTTCATACTAAGAGGGGGCTGGCTGGTTGCATATGTAGGATGTCCCATCTCCTGGCCCACTTCGTCA 3 1 3' arm Mus_musculus mirbase mir-448 2e-40 mmu-mir-448 4e-59 -50.7 .(.(((((((.(.((((((((((((.(((.(((((..(..((((.(((......))).))))..)..))))).))))))))))))))).).))))))).)............ (-50.70)