mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCAGTCCACGGGCATATACAC GTATGTGCCTTTGGACTACAT CTCCCTGGTGTGAGCGTATGTGCCTTTGGACTACATCGTGAACGCAGCACCATGCAGTCCACGGGCATATACACTTGCCTCA 3 0 3' arm Mus_musculus mirbase mir-455 5e-21 rno-mir-455 2e-35 -37.5 ......((.(..((.((((((((((.((((((.(((.(((.......))).))).)))))).)))))))))).))..).)). (-37.50)