mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGCTGGCCGTGATGAATTC GTCATACACGGCTCTCCTCTCT ACTTGGAGAGAGGCTGGCCGTGATGAATTCGATTCATCTAAACGAGTCATACACGGCTCTCCTCTCTTCTAGT 2 2 5' arm Mus_musculus mirbase mir-154 8e-35 rno-mir-485 5e-36 -35.5 (((.(((((((((..(((((((((((.((((...........)))))))).)))))))..))))))))).))) (-35.50)