mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAAAGGCTGTTTCTTGGTC CCCAGATAATAGCACTCTCAAAC TTCGGGTGAGAGTGAGAATCCTCTCTCCCAGATAATAGCACTCTCAAACAAGTTTCCATGTTGTTTGAAAGGCTGTTTCTTGGTCAGAAGACTCTCAATTTCTTCTGGA 4 2 3' arm Mus_musculus mirbase mir-488 5e-31 bta-mir-488 1e-37 -38.6 ((((((.((((.(((((.((.(((..((.(((.((((((.((.((((((((.........)))))))).))))))))))).))..))).)).))))).)))).)))))) (-38.60)