mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGACACCACATATATGGCAGC TGTCATATGTGTGATGACACTTTCT ACTGCTGCAGTGGCAGCTTGGTTGTCATATGTGTGATGACACTTTCTAAAGTCTTCCAGAATGACACCACATATATGGCAGCTAAACTGTTACATGGAACAACAAGT 2 2 3' arm Mus_musculus mirbase mir-489 6e-46 rno-mir-489 7e-30 -37.4 ..((.(.(((((((((.((((((((((((((((((.((.((..((((..........)))))).)).)))))))))))))))))).))))))).)).).))...... (-37.40)