mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAAGACTTGCAGTGATGTTT ACATCACAGCAAGTCTGTGCT GGGTGGGCAGCTGTTAAGACTTGCAGTGATGTTTAGCTCCTCTGCATGTGAACATCACAGCAAGTCTGTGCTGCTGCCT 3 0 5' arm Mus_musculus mirbase mir-499 2e-38 rno-mir-499 8e-29 -41.2 ....(((((((.((..((((((((.((((((((((((......))...)))))))))).))))))))..)).))))))) (-41.20)