mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTCAGAGGTCGATCCTGG AGGGTCACCCTCTGACTCTGT TGGGCCAAGGGTCACCCTCTGACTCTGTGGCCAAGGGTAGACAGGTCAGAGGTCGATCCTGGGCCTA 3 1 3' arm Mus_musculus mirbase mir-540 3e-31 mmu-mir-540 2e-32 -42 ((((((.((((((..((((((((.((((.(((...)))..))))))))))))..)))))).)))))) (-42.00)