mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGTCAGTTTATCAAAC TTGATAAGATGACATAGGA TGCTGTCCACAGTGTATTTGATAAGATGACATAGGAGAGGAACTTCTTTCACCTTTGTGTCAGTTTATCAAACCCATACCTGGATGAC 2 0 3' arm Mus_musculus mirbase mir-599 1e-43 cfa-mir-599 5e-21 -27.6 ....(((((..(((..(((((((((.((((((((((((((....))))))....)))))))).)))))))))..)))...)))))... (-27.60)