mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGGCGCCACTAGGGTTGTG CAACCCTAGGAGGGGGTGCCATTCA AGGAACAGCTATGTACTGCACAACCCTAGGAGGGGGTGCCATTCACATAGAGTATAATTGAATGGCGCCACTAGGGTTGTGCAGTGTACAGCCTACAC 1 4 3' arm Mus_musculus mirbase mir-652 5e-31 rno-mir-652 3e-35 -51.3 .......(((.((((((((((((((((((.....(((((((((((..((.....))..))))))))))).)))))))))))))))))).)))...... (-51.30)